圣石阵是一个由六个独立彩色箱子构成的关卡每个箱子都是一层独立的解谜空间，玩家需要逐层解开其中的视觉谜题和机关。这一关的结构较为特殊，它并非一个连续的整体场景，而是以嵌套的箱中箱形式呈现，玩家需要依次完成从外层到内层的六次挑战，最终抵达核心。圣石阵的谜题设计延续了游戏利用视觉错觉和几何结构的传统，但在此关卡中，通过分层独立设计，谜题的复杂性和步骤的阶段性更为清晰。玩家在通关过程中，需要依次面对颜色分别为红色、橙色、绿色、深绿色、机关色和粉色的箱子，每进入一层，场景和谜题都会发生根本性的变化。
第一层为红色箱子场景相对简单，关键在于理解并调整视觉角度，以发现隐藏的连通路径。第二层是橙色箱子，玩家会遇到一个可整体旋转的方形框架，该框架与楼梯连为一体，解谜步骤要求先引导角色至特定位置，再通过旋转框架改变结构与道路的连接方式，从而创造通路。第三层绿色箱子引入了多角色配合与分层控制，角色分处于不同平面，玩家需要操作右侧的按钮，分别控制左右两侧可升降的深绿色楼梯，将两位角色先后运送到目标门所层面。第四层深绿色箱子的核心机制是视角转换，操作角色踩下特定按钮后，整个视角会发生九十度旋转，角色进入倒立状态，原本看似无关的弧形道路会因此改变空间位置并与出口连接，若路径辨识困难，可以尝试变换观察设备的物理方向以辅助理解。
玩家需要先引导角色攀爬至楼梯顶部然后旋转楼梯的活动段落以改变其形态，形成一个可供角色垂直下落的平面。其后，通过反复旋转整个楼梯结构，利用其与联动的另一段楼梯改变场景布局，最终目标是让角色能够踩踏白色触发按钮，从而驱动平台转动，开辟新的前进路线。完成前五层挑战后，便进入最后的粉色箱子层，这一层叙事性大于解谜性，玩家将见证关键剧情的发展，并引导角色走到道路尽头的图案处，至此整个圣石阵关卡便宣告通关。
玩家需要依次解决基于视角错觉结构旋转分层移动和状态切换的各类谜题。每一层的挑战都建立在前一层掌握的技巧之上，但又引入了新的变量，如从单人操作过渡到双人协作，从静态结构变化到动态机关触发。通关的要点在于耐心观察场景中每一个可交互的部件，理解其运动规律与关联性，并按照正确的逻辑顺序进行操作，任何步骤的错漏都可能导致无法抵达目标。多角色关卡尤其需注意行动顺序和路径规划，确保为每位角色都创造出可行的通行条件。
