抓捕翼龙需要确保达到制作弓箭的等级，并准备至少50支箭和麻醉箭（麻醉剂与箭合成）。翼龙的首选食物是生肉，其中普通生肉或生鱼肉均可，但鱼肉效率较低。若条件允许，使用特级肉可显著提升驯服速度。建议提前制作木制或石制陷阱，通过门框和天花板搭建封闭笼子，留出侧面开口吸引翼龙进入。翼龙常栖息于山脉或海岸附近，尤其是地图中心区域，接近时需保持隐蔽以避免其逃跑。
使用麻醉箭射击翼龙时，优先瞄准头部或身体中央以提高麻醉效率。射击间隔需保持5秒左右，确保麻醉剂充分生效。翼龙受攻击后会尝试逃跑，需迅速追踪并持续射击直至其倒地。倒地后立即将食物放入其物品栏，翼龙会逐步进食并完成驯服。注意麻醉期间需定期补充黑果子或麻醉药维持眩晕值，避免驯服失败。
对于无齿翼龙等基础种类，可直接用流星锤束缚后以木棒击晕，但需提前准备麻醉药或生物毒素防止苏醒。风神翼龙等高级种类需借助飞行坐骑配合，通过爪钩或长管步枪远程击晕，并注意其坠落位置避免掉入水中。水晶岛的脊颌翼龙需用流星锁链困住后和平驯服，因其被激怒后会主动攻击，需确保首次接触时快速控制。驯服后的翼龙需装备对应鞍具方可骑乘，无齿翼龙需35级鞍，风神翼龙需97级平台鞍。飞行时双击屏幕左下角可加速，长按右侧屏幕可降落。
