被淹没的档案室是一个关键的主线任务场景，涉及复杂的解谜和战斗环节。进入地下区域后，劳拉需要通过狭窄的走廊，在尽头引爆希腊火罐子打通道路，随后抵达大厅找到阿特拉斯地图。会遭遇重甲兵围攻，需利用场景中的希腊火罐子进行范围杀伤。第一场战斗后，硫磺迷雾会限制视野，同时刷出第二波敌人，建议使用榴弹箭或毒箭快速清理。继续前进通过长水道可获得呼吸器，解锁无限潜水能力，这是后续解谜的重要前提。
档案室的核心解谜围绕炸毁雕像支撑物展开，共有三处爆破点。第一处可直接引爆附近的两个火罐；第二处需游泳至对岸，沿瀑布方向找到闸门，用弓箭拉开后释放火罐。火罐会被障碍物阻挡，需引爆清除障碍。第三处解谜最为复杂，需利用天平机关：先射击摇臂将其拉近，再绑上火罐使其倾斜，最后调整天平平衡让火罐漂流至雕像支座。过程中需注意绳索连接的时机，割断过早会导致火罐偏离路径。
战斗方面，档案室敌人以重甲兵为主，建议优先破坏场景中的油桶或利用毒箭削弱群体目标。潜水环节中，需留意水下通道的隐蔽入口，部分收集品如钱币储藏点需从左侧潜水或墙洞翻越。若遇到石碑旁的钱币，正面通道需返回前一张地图并炸开门才能通行。探索时务必频繁使用求生本能，高亮显示可互动元素，避免遗漏关键道具。
任务后期需快速逃离崩塌的档案室，沿途有不死军团追击，需熟练掌握跑酷操作。逃脱后前往观测站与同伴汇合，本章节即告完成。若需返回档案室收集遗漏物品，可通过地热山谷西北方向山脊重新进入，但部分区域因剧情推进可能无法再次探索，建议首次通关时完成全收集。对于卡关玩家，可重点检查天平机关的火罐路径或水下区域的隐蔽通道，这两处是常见难点。
